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重磅:2022年国自然申请“开锣”!附三大标书撰写工具

作者:admin 来源:未知 浏览: 【 】 发布时间:2021-10-25 评论数:

  该时间一定,标志着新一年度的国基金申请正式开锣,工欲善其事,必先利其器,有好的工具往往能让事半功倍。

  查文献始终是科研人员头痛的一件事儿,也是标书开题的首要工作,一大堆英文文献,你可能看的泪流满面、抓耳挠腮, 比如三阴性乳腺癌。

  你会怎么办?查文献?太慢! 别急,这个时候你需要一个叫“课题思路助手”的检索神器。

  一键查询,系统告诉从文献中查出与三阴性乳腺癌相关的基因有366个,信号通路29个。

  词云更直观的显示,相关基因中BRCA1和EGFR比较相关,信号通路和自噬,铁死亡等相关。 其实这个时候你已经对这个疾病的研究方向有一定印象了。

  咦,BRCA1可以理解,毕竟当年安吉丽娜朱莉切双乳就是因为BRCA1突变。但EGFR不是通常和肺癌有关么,带着这个疑问我们继续往下:

  点击基因的词云,进入到具体详情,结果页标注了每个基因的结果数。最高影响因子28.25,总影响因子达到192.53,左侧可以对年份,文本类型,影响因子进行筛选。

  选择刚才疑问的EGFR,点进去可以看到具体文献里的内容,浏览一下,可以得出结论,原来EGFR 因其可通过JAK/STAT3信号通路 促进三阴性乳腺癌,所以可以成为潜在的治疗靶点。点击 语料来源即可到文献原文,点击 期刊名即可查看期刊具体详情。

  从热图中可以观察某个基因在不同年份的热度,比如BRCA1和EGFR,STAT3都是近几年比较热的基因。

  通过以上简单的分析,相信对三阴性乳腺癌的基因及其研究趋势,热点都有大致了解。

  接下来看下和三阴性乳腺癌相关的信号通路,我们可以看到相关有铁死亡,焦亡,Wnt通路,mTOR通路,MAPK通路等点击右边的通路详情和参考文献可以直接连接到KEGG数据库的相关页面,非常方便。

  总之,通过这个工具,我们可以高效率对某一个关键词,它可以是基因,可以是信号通路,也可以是某一个表型或病种,通过海量文献找到与其相关的基因和信号通路,或高效了解某一个陌生领域,或找基因、信号通路之间的相互关系。只要抓住基因和信号通路两条线,那课题就思路就不是难事。

  比如我们通过检索发现,A功能可以由x基因高表达促进,同时A功能又可以由y通路的激活促进,那x和y大概率就是协同的,于是我们的课题就可以是x基因高表达激活y通路来促进A功能

  近年来,关于促进A功能的机制仍然不清,已知y通路是其关键通路,而x之前被发现可以促进A功能,但x是否通过y来促进及其具体促进机制尚不清楚,在这里,我们.....

  国自然资助率逐渐降低,竞争越来越大,你肯定想知道历年热点如何变化,既往立项的标题怎么写的,摘要怎么写?申请哪一个科研口命中率更高?等等疑问...

  进入以下这个工具,直接输入关键词搜就得了,过去20年的国自然数据,看看成功案例是怎么写的。

  左边可以对检索结果进行二次搜索,以下类目展示了各个分类的数据,比如干细胞谁最牛,张勇教授! 独得8项。哪个机构最牛?上海交大,中山独领风骚(怎么感觉可以拿来找导师用哈哈哈,毕竟经费是钱袋子,有钱不一定有好日子,但没钱肯定没好日子....)

  干细胞主要集中在面上项目和青年科学基金,从最近5年立项数来说,很稳,但也没有特别增长,说明国家对这个方向是持续支持,该方向也并非新方向的爆发性增长。

  搜索结果再往下看,竟然有地域分布图,那个省干细胞立项的多,根据颜色深浅,一目了然。 点击某个省,该省哪个机构立项最多,谁立项最多,右边列表都在了!

  干细胞历年立项数据引入眼帘,还可以以立项类别,依托单位,学科分类,负责人分别展示...

  总之,这是目前小编使用过最强大的国自然分析系统,极其实用!再有人问你某个领域的国自然情况,你是不是就可以给出一串data惊呆ta了呢?

  标书里很重要的一个部分就是工作基础,一看之前有没有相关文章发表,另一个最直观的就是你有多少相关数据,是否扎实,那如果还没有临床样本,又如何获得数据呢?这时候大数据生信挖掘就很有用,真的可以拿别人的数据写自己的标书。

  这时就和大家介绍第三个工具,不需要任何R语言代码基础,就可以挖掘TCGA和GEO的海量肿瘤和非肿瘤数据。

  平台是由几个临床医生联合生信大拿一起搭建,界面极其简介,左侧栏是TCGA上所有33种肿瘤类型,之后第二期会纳入非肿瘤的疾病。顶部是各种分析模块。 首页特别注明了,所有数据均由R v4.0.3分析完成, 意思就是说在平台上分析的结果和拿R语言敲代码分析的结果是完全一样的,这就太爽了。

  别看界面简单,该平台功能极其强大,比如想分析下“某个基因在肺腺癌里EGFR突变和野生型病人中表达水平和预后差异”就轻而易举。

  平台有极其强大的样本筛选功能,可以对样本进行除了临床信息,治疗信息的进一步筛选外,比如可以根据某一个基因是否突变筛选,某一个基因的表达量水平进行筛选,比如近年来火热的肺腺癌EGFR野生型伴PDL-1低表达相关研究,就完全没问题了。这也是目前已知所有第三方网站无法实现的。

  单样本分析,顾名思义就是针对某一个样本的分析,里面的工具目前包括了临床信息比较,批量生存分析,基因与生存,基因与TMB/MSI,桑基图,两基因相关性。

  多组生存,基因表达比较,miRNA比较,突变比较,免疫评分,免疫检查点, 甚至铁死亡,m6A。

  在复杂分析里,集成了以下耳熟能详的分析模块,比如亚组分型,基因突变景观,差异基因分析,预后模型(列线图),预后模型(Signature) ,泛癌分析。

  然后,在思维导图和视频教程里,180师兄和911师兄讲解了如何使用“十字研究法”,交叉运用单样本和多样本工具,让课题设计思如泉涌。

  这些分析如果让公司去做,估计要几百上千甚至上万了,而这个平台鼠标点击几下,就可以生成所有的高清矢量图,更重要的是还有对应的原始数据下载,这个相当重要。

  不仅如此,平台还针对每一个分析结果,给出了对应图例,方法学,结果的中英文对照,和参考文献,这个对我们写文章也很重要。

  从课题设计,工具使用,再到零代码,一键分析,原始数据下载,再到论文写作,这就是一个贴心的“0代码”生信分析工具。

  综上,我们提供了3个工具,从国自然既往大数据分析,到课题思路挖掘,再到工作基础准备,相信会帮到大家的国自然标书写作。